Fortanete es un municipio que destaca por poseer entre su patrimonio natural una gran extensión de pino silvestre, ocupando casi el 50% del término municipal. La Rambla del Mal Burgo nace en la localidad, la cual más tarde se convertirá en el Río Pitarque cuando llegue a la surgencia conocida con el nombre de "nacimiento del río Pitarque", en el citado municipio. En el resto del término destacan los pastos naturales, y las zonas degradadas de pinar ocupadas por el enebro y el boj. Destaca la presencia del acebo en las zonas más humedas, con importantes rodales distribuídos en los barrancos de umbría.